De stuurgroep zet de grote beleidslijnen van het NCF uit en is verantwoordelijk voor de uitvoering van alle activiteiten. De stuurgroep bestaat uit de volgende leden:
Geert van Dartel, voorzitter Raad van Kerken
Wilfred Fijnvandraat, directeur Agapè
Peter Grim, Verenigde Pinkster- en Evangeliegemeenten
Wilkin van de Kamp, predikant-directeur Vrij Zijn
Petra de Nooy, Protestantse Kerk in Nederland
René de Reuver, Protestantse Kerk in Nederland
Bernd Wallet, aartsbisschop Oud-Katholieke Kerk